全幅切片图像(Whole-slide images) 是使用特殊扫描仪扫描的高分辨率物理组织病理学图像,产生的图像具有数十亿像素。它允许科学家、研究人员和临床病理学家使用软件对感兴趣的区域进行放大。全幅切片图像查看器在不同领域中被用于医学诊断、术中诊断、医学教育、医学生培训、诊断决策支持系统、临床研究和免疫组织化学(IHC)等方面。
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是全幅切片图像的一种,在 windows 上可以使用 Aperio ImageScope,但使用中文检索,无法快速查找到 macOS 版的替代品。
本文整理了两款 macOS 的全幅切片图像浏览器。
QuPath 是一款免费且开源的定量病理学和生物图像分析软件。跨平台,可在 Windows、Mac OSX 和 Linux 上下载使用。它旨在提供临床病理学所需的全幻灯片图像分析功能。另外,QuPath 支持与其他开源工具(如 ImageJ)进行数据交换。
Cytomine 是另一个替代品,它是一个开源的整合式全幅切片查看器和分析平台。它支持多种虚拟切片(WSI)格式,可在 Windows、Linux 和 macOS 上运行。通过其基于 Web 的客户端,它支持外部团队和研究人员之间的协作和远程分析。
另外,如果想对全幅切片图像进行标注,可以使用 ASAP。